O Prêmio Empreender tem como objetivo dar mais visibilidade aos núcleos setoriais e consultores que realizam projetos de destaque. É concedido às melhores práticas do Empreender voltadas para o mercado, tecnologia, gestão e cultura da cooperação cujas ações e resultados possam ser replicados em benefícios das micro e pequenas empresas de forma a melhorar sua competitividade. Após análise dos inscritos, os cinco melhores são divulgados para que, no congresso anual da CACB, sejam anunciados a associação e o consultor vencedores. São homenageadas também as entidades e atores vinculados aos relatos dos núcleos setoriais classificados em 1º, 2º e 3º lugar: técnico do SEBRAE local; empresário representante do núcleo setorial; Federação; Sebrae estadual.
Na edição de 2008, após análise de 72 inscritos, os cinco finalistas foram os núcleos setoriais de turismo (Brotas/SP), bares, restaurantes e orgânicos do Vale (Vassouras/RJ), informática e telecomunicações (Cascavel/PR), indústria de vestuário do oeste catarinense (SC) e gastronomia (Holambra/SP).